阿里还效仿西方，设立内阁，设置军事、司法、财政、商业、教育、卫生六部，独揽政治大权。他还经常去全国各地考察，了解政策的执行。并且建立起了一套严密的统治体系，通过严刑峻法很快改变了埃及的政治面貌，实现了国内的大一统局面。
那么如此努力富国强兵的阿里他成功了吗？
阿里的改革和建设，推动和恢复了生产，使埃及的经济出现了繁荣景象。
全国耕地增加130万费丹（约合780万亩），国家财政净增200%，全国人口增加到450万。
军事上陆军人数增加到20万人，海军2万人、拥有三十二艘军舰。入侵苏丹，并且趁希腊独立战争期间霸占了克里克岛。发动第一次土埃战争侵占巴勒斯坦和叙利亚。
到此为止阿里可以说是非常成功，从一个孤儿到埃及实际上的统治者，并且将过去的宗主国打的满地找牙。近代第一个完成西化改革的非洲国家。
但很可惜，欧洲想要的只是一只看门狗，而不是一匹想要吃肉的狼。
1840年7月15日英、俄、奥、普、土五国在伦敦签订伦敦条约。
对埃及发出最后通牒，阿里断然拒绝。他不想自己的大国梦破灭，接受这个条约意味着他一生的努力将付诸东流，同时埃及将丧尸独立，回到过去成为奥斯曼的附庸。
还有就是他已经被之前的胜利冲昏了头脑，在面见英国大使时居然说“五国同盟想要使用武力，那就请便，我穆罕默德·阿里在此恭候。如果你们英国人想要单独行动，那我更欢迎。”
阿里下令全国进入战争状态，加固城防，储备粮食，积极备战，准备和欧洲人开战。
然而同盟国还真没有把一个非洲国家当做一盘菜，9月英国舰队联合俄、奥、土耳其（奥斯曼）三国舰队进入地中海，炮轰贝鲁特。1500名英军在贝鲁特登陆，横扫了阿里在黎巴嫩沿海的部队。
同时英国人发挥了自己的传统特长，煽动叙利亚人起义并给他们提供枪支弹药。叙利亚人早就对阿里的统治不满，一时间战火四起。
埃及军队在正面无法对抗英军，海上他们的三十几艘军舰在四国联合舰队面前犹如玩具船。就算是列强中最弱的奥地利海军，也能实现单方面吊打埃及海军。仅仅是与联合舰队的先头部队，试探性的交火埃及人便损失他们四分之一的舰队。
法国人曾经支持过埃及，但是此时见埃及大势已去，便要求阿里做出让步，与苏丹谈判。
听人劝吃饱饭，阿里作为一代枭雄立刻放下了自己的面子开始和奥斯曼苏丹谈判。
阿里表示愿意从阿达纳、克里特岛。阿拉伯半岛和叙利亚撤军，以保住自己在埃及的世袭统治权和阿克（叙利亚的一个地区）的终身管辖权。