但是，无论是高强度训练，还是抗打击训练，都让日向信玄发现了一点，那就是查克拉的创造修复性。
在打桩训练中，手掌与木桩撞击，相互的力会导致手掌皲裂，出血。这也是为什么那么多体术型忍者手上绑着绷带的原因——上面满布着伤痕，很难看。
但是，当人一边提炼查克拉，一边进行打击训练的时候，查克拉就会随着受伤部位的变化而散溢。
当日向信玄主练腿掌的时候，贯通全身经络的查克拉便会在经过腿部经络的时候，散溢出一小部分修复小腿，经过手部经络的时候，散溢一部分修复手掌。
然而，当他主动将查克拉运转到受伤的手掌与小腿时，查克拉却凝而不散，没有丝毫散溢的意思。
这一点让他感到十分困惑。
不过，在后续的大量实验中，他发现查克拉的这一性质并非他的错觉，而是事实——某一部分查克拉，确实是对受损肉体具有修复功能的，但并非随便聚集一部分查克拉就能修复身体。
日向信玄猜测，这一点可能与千手纲手研究的医疗忍术有所关联。
只是因为相关医学知识不足，日向信玄暂时记下了这点，继续进行其他方面的研究。
在那之后，透支生命力提炼查克拉的实验出现了一点意外成果。
当他在精神空间中，反复透支生命力提炼查克拉，而后又通过进食、药补、药浴等方式补充自身之后，脏器开始出现衰竭症状，后来没多久这一轮的意识体就开始吐血衰弱最后虚弱而死。
这轮实验证明，过度且不合理的透支生命力，是无法通过简单方式补充回来的。
玩命，就得死。
有趣的是，他死时的状况，看上去和鼬病重时的状态差不多。
根据日向信玄的大胆猜测，宇智波鼬可能就是因为不科学不合理的透支生命提炼查克拉，导致生命能量长时间虚弱，身体状态虚弱，免疫力低下是必然的。
最终会像患了艾滋一样虚弱染病而死，也就可以理解了。
于是日向信玄变得愈发谨慎起来。
在现实世界中时，每天除了训练，还会专门抽出一部分时间自学医理基础，尤其是有关调理自身方面，看得尤为细致。
日向家族方面，对他这个新一代的‘日向第一天才’也是尤为看重，在他表现出超凡的体术才能和学习能力之后，家族不吝花费，从前线请来了一位经验丰富的日向医疗忍者为他进行一对一式教导，这也为他学习医疗忍术打下基础，铺平了以后的道路。
而且因为精神空间里可操控时间和身体的缘故，有能力进行大量自我实验的日向信玄在学习医理方面进步极为迅速。
当然，体验各种死法的滋味也不会好受就是了。
在理论支持的基础上，信玄开始从微观方面研究提炼查克拉时的身体细微影响，为此甚至还在只有一百多平米的精神空间内，具现了一个完整的医学实验室，各种设备十分齐全。
自那之后，日向信玄对查克拉与身体素质变化的研究才算是真正开了个头，他的研究也愈发深入。
不过与此同时，他的修炼也没有停下，而是保持着非常固定的两点一线。
晚上：凭借精神空间的可操控时间与无限读档，研究自身的查克拉和身体素质提升方法
白天：将夜晚的正确研究付诸实践，并为接下来的研究继续提供意见，并向家族医疗忍者请教、学习有关知识
在这种反馈性极强的研究和训练过程中，日向信玄以常人难以想象的速度充实自我，日复一日的解决一个又一个自己修行路上的难题，扩充技能库。
第二次忍界战争，也在这样的修行时光里逐渐走向尾声。