除了在南京战场这个绞肉机里的消耗之外，就连运载部队渡江南下本身，也是一件非常危险的事情。崇祯皇帝的水军虽然实力有限，但依然顽强地航向长江下游，时不时地偷袭运载清军渡江的船队。
而自从南京的永和帝朝廷瓦解以来，被东林党控制的原南京朝廷长江水师，也不断地有人哗变倒戈，导致先后有三千多名不识水性的满洲大兵，随着沉船坠入大江喂了鱼鳖。
在此时的燕子矶大营里，皇太极的旗下还有一万一千满洲八旗兵，一万八千各色杂牌汉军，外加寥寥数百名蒙古人和百余名朝鲜火枪手。整个大清帝国剩下的全部家底儿，几乎都在这里了。
至于原来那个南京朝廷的兵马，在此时已经彻底瓦解，对皇太极而言完全派不上半点用场。
南京争夺战打到了现在这一步，皇太极已经没有了任何退路，如果失败的话，就只有死路一条了。
虽然如今在淮北的徐州、济宁一带，还布置有多尔衮、多铎、阿济格三兄弟的两白旗，超过六十个牛录的满洲勇士，但皇太极很清楚，自己就算是英勇地战死在南京，也比回去看这三兄弟的脸色要强得多！
事实上，虽然皇太极被誉为大清的一代明君雄主，但至始至终，他的君主地位都非常尴尬。
要知道，努尔哈赤在临死的时候，原本是想要让多尔衮继承汗位的，甚至把自己的嫡系部队都给了他。所以，多尔衮三兄弟当时掌握着整个后金集团内部实力最强大的两黄旗，而皇太极麾下的两白旗却是最弱的。然而，皇太极成功地团结了其余四个旗的掌权贵族，一齐打压当时还是小孩子的多尔衮三兄弟，终于逼死了多尔衮三兄弟的母妃阿巴亥，夺取了后金大汗的宝座。
因此，在成功继位之后，多尔衮就成了皇太极的第一个打击对象。随着皇太极一纸令下，曾经是努尔哈赤直属禁卫军的两黄旗，连番号都保不住，直接改成两白旗，皇太极自己的两白旗则变成了至高无上的“两黄旗”。互相换旗之后，接下来不用说，在六个旗的进一步联手打压之下，多尔衮三兄弟麾下的各个牛录被不断调走、削弱，成为了第一个被皇太极收拾干净的政治集团。
可是，为什么皇太极没有继续置多尔衮于死地，反而又渐渐将他和多铎、阿济格给提拔了起来呢？
因为，无论在军事斗争还是政治斗争之中，敌人和盟友的角色都是在不断变换的。在击败了年幼力弱的多尔衮三兄弟，坐稳了后金大汗宝座之后，皇太极的主要政治对手，就不再是这三个已经失去了威胁的幼弟，而是帮助他夺取汗位的阿敏、莽古尔泰、代善这三个大贝勒了。要知道，在当时的后金内部各大势力里面，皇太极的嫡系是最弱的，除了拥有一个大汗的名分之外，阿敏、莽古尔泰、代善麾下的实力都比他要强，或者至少是相差无几。为了对付阿敏、莽古尔泰和代善，缺乏嫡系实力的皇太极，又不得不把年龄渐长的多尔衮三兄弟给抬举了起来，让这两白旗的三兄弟打头阵，通过各种手段对付三个大贝勒。
结果，就像跷跷板一样，在皇太极把三个大贝勒给相继打倒之后，两白旗的势力却急速地膨胀了起来。比如阿济格在眼下就已经成了大清帝国的第一勇将，在八旗军中威望卓著。多尔衮则智勇兼备，十七岁的时候就因战功卓著被封为聪明王。就连多铎也在入关之后的战事之中屡建奇功。两白旗更是积累了大量的丁口和财富。更糟糕的是，虽然皇太极之前百般设计挑拨离间，但始终没能破坏这三兄弟的团结一致。
原本，以皇太极的雄才大略，接下来肯定还有一系列压制两白旗的手段。而他也确实早已预备了伏笔在多尔衮三兄弟给皇太极充当走狗，撕咬阿敏、莽古尔泰和代善三大贝勒的过程之中，两白旗不可避免地与两红旗、两蓝旗结下了深仇大恨，日后完全可以再一次借力打力，重新联合六旗把两白旗打压下来。
谁知就在这个节骨眼上，大清帝国却莫名其妙地遭到了毁灭性打击，苦心经营了多年的辽东故地瞬间易主，盘踞河北的关宁军竖起叛旗分道扬镳，满洲八旗回家的道路从此断绝，大清旗下的汉军和蒙古盟军也相继叛变……在这种土崩瓦解的恶劣局势之下，焦头烂额的皇太极根本就顾不上再对付自己人了。
再接下来，还没等大清帝国从连番挫败之中缓过一口气，皇太极就突然得知江南局势有变，又有张溥代表东林党和复社，秘密渡江来向清军求援。于是，皇太极唯恐错过这一难得的战略机遇，几乎是马不停蹄地就往扬州赶了过去，同时传令全军尽数南下，不惜一切代价也要把天底下最富饶的江南给抢到手！
注意，在这时候，皇太极的计划是尽发倾国之兵南下，把整个满洲八旗全都投入到江南战场上！