荷兰人当时的优势在于他们的战舰以及武器。荷兰人的战舰往往航速更快，炮台也更多，而且舰炮射程也增加更远，为明军所难及。
此时的欧洲军队主要发展炮口装填的铜制前膛滑膛炮，而明军制造、使用的多铁质，其中中型、重型火炮则以佛郎机为主，红夷大炮为附；佛郎机为后膛炮，红夷炮为前膛炮
而在众多的佛郎机炮系列中，明军使用最普遍的为弗朗机子母铳火炮，这是一种中型火炮，射速极快，在此时可谓是冠绝中西的，不过为了射速只能舍弃其他，威力相对较小，只能用作野战炮而不作攻城炮，射程在同种类型的火炮中也是较短的。用这个对付几乎没有重型火器的后金和蒙古人，完全游刃有余，但这在与有掩体、射程长的荷兰人的炮战中就很吃亏。
其实，此时明朝使用的铁质铸炮技术是比同时期的欧洲先进的，但是因为体制腐败等问题，质量往往惨不忍睹，完全不能发挥出应有的效果。
（即使是在清代鸦片战争时期，中国的铸炮技术也并不落后，清代的铸炮技术也在一直发展，但是造出来的炮已经很落后了，鸦片战争时期清军用的炮还是康乾版本，而且同样因腐败问题导致质量十分堪忧；甚至当时，还有清代地方官搞行为艺术，造了一大批明朝、元朝时期的炮，但因认真监督质量很好，导致它们反倒比更先进的清代炮威力大。）
而后装炮从理论上来说并不比前膛炮差，但由于当时技术原因的限制，火药气体的外泄问题难以解决，所以在实战中，前膛胜于后膛。而西方更是不断发展，弥补了前膛炮的不足，但此时的大明并没有跟上时代，导致火炮无论是在技术上还是在实战中都落后于西方。
所以对付封锁港口的荷兰舰队，南居益知道唯为智取。荷兰战舰质量虽高，但数量稀少，此时荷兰人一个个已是提前的沉浸在胜利的喜悦中，不少人是喝得酩酊大醉。
明军士兵借着夜色乘小舟偷偷摸到荷军舰跟前，小舟里或上乘火药、柴草，或是手持兵刃的精锐士卒，港口中福建舰队更是随时准备杨帆。却看天空中乎的生起一枺烟花，士兵们迅速登船一拥而上，火船也是跟进往敌方舰队中横冲直撞，港口里等待多时的大明福建海军舰队快速出动冲破封锁，誓要扬眉吐气。最终荷兰封锁舰队几乎被一网打尽，生擒红夷二十六人，缴获军舰四艘，烧毁八艘，击沉六艘，逃亡三艘。
至此，明军总共消灭荷航16艘，前来侵略的荷兰军舰已经被消灭近半，失去控海权的荷兰人不敢分散，只能困守澎湖。
南巡抚向福建的各富豪士绅、海商收取抗夷捐，以充军饷，顿时明军士气大涨。
士绅们自然是不愿意出钱的，但荷兰人占领澎湖，已经严重打击了他们的海上贸易。荷兰人占据澎湖之后，在当地禁止中国商人通航，以各种手段来打击明朝的海外贸易，禁止明朝、西班牙二国商人往来彭湖一带发展贸易，一经发现，船只和商品都会被没收。
虽然此时的大海商都有海盗的兼职，但是怎么可能打得过正规军呢？
士绅们见自己的财路被断，又看了看大明丘八们对自己虎视眈眈的目光，不得不做出同仇敌忾、为国分忧的样子，咬着牙把钱给交了。
‘大不了等以后再找人，弹劾这个姓南的，你等着吧！’老爷们如是想着。