此时朝中终于有人想起了袁可立，并在朝会上复议，是否诏令袁可立官复原职，继续巡抚登莱。
但遭到了阉党和东林党的共同反对，为了一劳永逸，他们在廷推上一致谏言由袁可立去南京担任户部尚书，皇帝同意了，袁可立从此远离北方。
又过三年，东江镇总兵官、平辽将军毛文龙被袁崇焕矫诏杀死，东江军民之心崩溃，当日袁可立复辽的三大将就此黯然退场。
威名远播的登莱东江三镇彻底崩溃，不复当初，袁可立耗费三年时间打造的防线战场一朝尽丧。
而此时的袁可立早已向朝廷辞官，他于家中听说此事后，心力交瘁，一病不起，不久后辞世。
后来奴酋皇太极称帝立国，震惊天下，有一名官员这样说道：
袁可立未出，金人陷沈阳陷辽阳又陷广宁，京师戒严，朝野震动。
袁可立出镇，修战舰练强兵联诸岛收辽南，策反降将，主动出击，退敌于千里之外。狡虏蜷伏一隅，三年不敢动。
上兵伐谋，良将不战。袁可立之战，贵在主战，贵在不战养威，不战而屈人之兵，善战而以战止战。
舳舻列阵，奴酋胆寒。
袁可立去职，张度死柳河败，阁老不能持辽局。
金人无惧，劳师袭远，掠觉华攻宁远，玩“议和”断邦交，弄明师于股掌之上。
文龙死，登莱溃而朝鲜又残，大明再无完瓯。
袁可立去留天壤有别，高下立见。
人夺可立天夺大明。
惜哉！
“爱卿的大名可是如雷贯耳啊，民间都说爱卿是在世青天，朝中官员也无一不称赞爱卿品德，朕可是早就想见见连爷爷都夸赞不已的人了！”
袁可立连忙躬身说道：
“臣汗颜，这只不过是外面虚传而已，臣也不过是普通人，在其位谋其事而已，臣既然在朝中为官，那自然是要秉公执法，还百姓一个朗朗乾坤！”
“好一个普通人啊，爱卿此言可是令得那些尸位素餐、欺良压善之人无地自容，爱卿还是太过自谦了，这可不好！”
“那些所谓当世大儒、能臣仕子在朕面前无一不是夸夸其谈，吹嘘自己多有才华，朕今日见了爱卿可是与这些人形成了鲜明的对比啊，要是让他们知道了，朕都想不出他们的脸皮该如何放。”
正如历史所言，袁可立与那些庸才的差距太大，光是从这自谦的态度来看，就高下立判、孰优孰劣。
不像某些沽名钓誉的老匹夫，自以为是帝师就了不起，弹劾这个又弹劾那个，显得他自己多厉害一样。
“陛下谬赞，臣实在担不起这等名气，只是陛下所言不错，如今的朝堂，遍布歪风邪气，不论皇亲国戚还是勋贵官员，处处在攀比，臣也深厌其烦！”
朱由校感慨道：
“看来爱卿还是个明白人啊，能在这混世中坚定初心，可是极为难得，爱卿可比朝中大部官员强多了！”