“从NERV成立之初，就没打过这么大手笔的仗啊……”Q版美里感慨着。
“其实第三新东京市的防御系统还是挺大手笔的……”
“但是没用啊，看着打的热闹就是了，全是浪费税金，昂贵的炮仗而已。但是你看，现在多过瘾。”
“……兹……兹……这是人类的夙愿……”
“前方出现新的EVA反应！”
“SEELE终于登场了吗……”美里捏紧了扶手。
“不存在于计划中的第十四号机吗……”碇源堂在十三号机中都握紧了操纵杆。“SEELE连最后一点矜持都放弃了吗。”
“……兹……就让我等以这亚当的遗骸建造的……
初号机和十三号机同步率都从常规模式进入到超越100%的非人模式。
头顶都出现白色的光圈，碇真嗣的眼睛也开始发出红色的光芒。
初号机攥着WILLE之枪，十三号机攥着合二为一的卡西乌斯枪和朗基努斯枪，在和新出现的长着亚当的七个眼睛的脸的新EVA交错的瞬间，新的EVAAT立场瞬间破碎，被分尸成六块，向下方坠落而去。
“明日香，玛丽，丽警戒新出现的SEELE的EVA，很可能像亚当的容器一样是全身核心的结构。”美里联系上在前面给舰队开路的EVA驾驶员。
“盯着呢，以SEELE那个赖皮的习惯怎么谨慎都不过分。”
然后在十四号机坠落到南极大陆地表的时候，炸开了巨大的十字爆炸。
众人：“……”
“初号机以及十三号机，敌战线突破，已经突入GUF之门。”
“交给你了啊……真嗣君。”
“这里是……”碇真嗣驾驶着初号机突入了GUF之门，等进入门时候的黑暗消失后，碇真嗣发现自己站在一片城市中。
是比例尺很奇怪的第三新东京市。
“这里是世界的里侧，里世界，逆世界，镜像世界，世界的倒影，负极宇宙，随你怎么叫。”碇源堂驾驶的十三号机也抵达了里世界。“这里的一切都是虚假的，一切也都是真实的，是梦和现实的边界线，是人类无意识的集合，也是人类的理想乡，一个永远不会前进的世界。一个活着但是已经死了的世界。”
“……好复杂。”
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“无所谓，开始吧，真嗣，想象你理想中的世界。一个对任何人都温柔的世界。”十三号机展开四个手臂，缓缓的升上天空。
“好的父亲。”初号机也张开手臂，缓缓升上天空。
“虽然有点晚了，但是抱歉了呢，真嗣，我一直不相信感情这种看不见摸不着的东西。我拒绝相信有人会爱我这件事情，我总觉得在你身边只会伤害你，所以选择了离你远远的，什么都不做。”
“我知道。”
“嗯……”碇源堂摘下了墨镜，露出了他已经非人化的眼睛。
“那么我当EVA驾驶员时期的工资什么时候发？”
“……”碇源堂感觉自己情绪被打断了。“你工资一直有发，卡在葛成那里，听说用来还车贷了。”
“……”碇真嗣感觉自己的情绪也不太对。
“……算了，你设定新世界的时候给葛成设定上背着三十年房贷好了。”
“……这个可以有。”碇真嗣闭上眼睛，初号机和十三号机的AT立场开始同步，两台机体打破了物理界限，融合在了一起。开始了最终的人类补完计划。
首先是第一步，表世界L结界浓度极速上升，由地球产生的高强度反AT立场崩坏了所有源自生命之卵的生物的AT立场。
包括EVA、WUNDER、人类等在内的所有生物瞬间崩解为了LCL。
然后是第二步，表世界的地球，以南极为起点，L结界浓度飞速下降，大地迅速恢复到了第二次冲击之前的样子——拥有蔚蓝的大海以及葱郁的大地。
随后是第三步，所有的EVA相关物，包括L结界中和装置、NERV机关的设施、WILLE的相关设施等全部化作了光粒子，消散在了空气中。
取而代之的是，一般没有EVA的地球在那个时间点会拥有的建筑和设施。
第四步，碇真嗣、碇巍、碇源堂和自己的相关者道别。
碇真嗣找来了美里、绫波丽、Q版明日香道别，顺便和Q版明日香表了个白并且以伊安的外形帮明日香补完了亲情的缺失，就直接把这三人踢出了这个世界。
碇源堂稍微跟冬月交代了一下后事，和律子道了个歉就跑了。
至于碇唯，把SEELE的那群人拉进来好好的嘲讽了一通，找冬月叙了叙旧，找真希波·玛丽叙了叙旧。
“永别了，所有的Evangelion。”
碇真嗣在心中默默的说道。
“要幸福啊……明日香。”
然后，1+13号机和碇真嗣同步率报表，1+13号机眼睛瞬间变成红色圆形，S2机关从胸口暴出，1+13号机分别握着WILLE之枪和融合后的朗基努斯枪和卡西乌斯枪。
把两把枪再次融合，象征着人的意志和神的意志达成统一。
用力向后一捅，把融合过后的长枪捅进1+13号机的S2机关中。