蛙人目前地面部队的优势已经荡然无存，所幸还有绝对优势的空中打击。而鼠人则获得了地下的优势。可以发挥他们快速挖洞的本领。
很快之前杰克利用鼠人的各种城市都遭遇了不同程度的袭击。使得蛙人本来就不足的劳动力缺口更加的捉襟见肘。而且鼠人从地下而来的攻击使得防御工事形同虚设，而加强地下防护又谈何容易？
这些城设计之初就是设计鼠人居住。要防御的对象是晴雪和林2蛙两个邪魔。所以城市是外墙坚固，而内部可以向下挖很深。为了保持城市不出现坍塌等等，一些主要街道和主体建筑的地基异常的深，构成了城市的蜂窝煤一样的结构。
而蛙人在鼠人的连番打击之下，本来预计增加了5万人的计划还没开始，遭遇的袭击减员不断攀升！杰克决定痛下决心放弃之前尼霍德王建设的全部城市。所有能运的东西全部运走之后，由环形战机将全部城市炸成一片废墟。
杰克准备在豌豆森林之间的荒漠地带，以及豌豆森林内，建造蛙人城市，虽然水源等等是个问题，但是防御来说就不是个问题了，鼠人的挖洞能力虽然强但是突破豌豆复杂且非常深的根系时候，造成的损伤会使得豌豆释放出毒素。
3座豌豆山之间的空白地带建造生产基地。这一系列新规划进展顺利，以及更好的规划了符合生产和生活需要的各种细节，并且兼顾了生产和防御的需要。一些特殊单位还在地下做了特殊防护。
但是原来的鼠人3号城的矿产成了一个麻烦。一来这里的矿产是杰克非常需要的，二来这里并不利于防守。各种措施都难以防御鼠人从底下发起的攻击，虽然有所防备的蛙人几乎没有人员伤亡，但是各种采矿的大型机械几乎难以运转。矿产供应基本中断。
杰克只能使用很有限的一些战车改造的小型机器开采一点就带走，设备和人员都过夜这样的零星开采。但是这样的数量锐减，对于更多的防务需求和科研需求来说杯水车薪。蛙人的进步陷入停滞。
而这时候长顺逐渐恢复了健康。但是治疗其实没发挥什么作用，按照林2蛙的分析，几乎是等着长顺他们这批士兵缓慢的新陈代谢，缓慢的自身排毒，过敏物质的浓度降低到安全水平之后才正常苏醒。
尚无有效药这样的消息令杰克以及整个蛙人群体都一筹莫展。
而另一面，鼠人可以说一扫之前的阴霾，整个一族都欢心鼓舞，开始建造地下城市。扩充粮食来源，克卢多之前也曾经因为经济改革而被尼霍德王重用，如今也开始鼠人的地下王国的建设。
因为胜仗越来越多，因此克卢多巧妙的将之前号召鼠人离开蛙人城市时候，说的尼霍德王再现说成是自己梦中受了王的启示之类。进一步神话过去的尼霍德王来达到凝聚人心的作用。人心齐泰山移，虽然蛙人的武器装备上还有巨大的优势，但是目前鼠人的武器不会是完全无效的，而数量则是蛙人的百倍以上，再加上有了精神寄托凝聚人心。鼠人中无数敢死之士对蛙人的城市不断实施袭击。
在杰克尽数放弃之前占领的鼠人城市之后，虽然是被轰炸的只剩一片瓦砾，但是还是很多人去居住在瓦砾下面。
包括克卢多选择在4城下建设前进基地，准备进一步的打击蛙人势力！
但是再往前，由于豌豆山复杂的根系，以及豌豆根系的特殊性，鼠人想进一步破坏蛙人的设施也很难。双方基本以之前王城所在的高原为边界形成了各自的实际控制区。