在袁可立、袁应泰前往沈阳之前，朱由校特地叮嘱他们警惕入城的蒙古人，防止奸细与建奴里应外合，导致沈阳失守。
虽然知道历史如何发展的，但是无可奈何自己在朝堂上十分弱势，缺乏足够权威，而且没有自己人。
只有以后用实力来堵上东林党人的悠悠之口。
朱由校在明珠市读大学的时候，曾经用电脑查找了东林党的相关资料，由此掌握了许多明末党争的信息。明末的党争的“党”并非近代政党，而是结党营私的“朋党”，明末官僚机构中因地缘关系结成的政治派系﹐浙党﹑齐党﹑楚党的合称。
东林党，像赵南星，刘一燝，韩爌，杨涟，左光斗，周嘉谟，以及不在职的叶向高，李三才等人都是东林党的著名人物，孙承宗也是；
然后就是楚党，象官应震、吴亮嗣、黄彦士就是，熊廷弼也是楚党；齐党，给事中亓诗教、周永春就是；浙党，象首辅方从哲和给事中姚宗文。
目前，在朝堂上，东林党势力最大，因为他们在先帝当太子一事上出力最多，而且，之后在“移宫案”中帮助自己顺利登基，暂时不能撕破脸皮。
面对当前朝堂上结党营私拉帮结派，激烈斗争的状况，要是换了明太祖朱元璋，这些家伙绝不敢如此嚣张，这些文官早就被抓的，杀的杀了。
为什么朱由校不能学太祖皇帝用强硬手段呢？今时不同往日，朱由校没有足够的权威，更没有强大的武力和深厚的经济实力。搞不好会被大臣们架空，说不定哪天就不知不觉落水或是其他原因就挂掉了，像明武宗。
大明的官员怎么就不能像建奴一样团结呢，虽说人家内部也有很多矛盾，但在大事上面基本上没火拼起来，没到你死我活的地步。
比如，建奴酋长黄台吉死后，在各方妥协下，由顺治小皇帝登基，后来又在多尔衮的带领下入关逐步夺取天下。
看来，朕摊上了一帮猪队友啊，太坑了。虽然我大明有像孙承宗之类的大明忠臣，在清军攻城时奋力抵抗，被俘后不愿投降最后自杀殉国。
但是，这类忠心耿耿的人太少了，大明很大程度是这些“猪队友”导致的。
所以，朱由校应该做的就是提拔一些可为自己所用的官员，像孙传庭，徐光启之类的能人。
孙传庭接到皇帝宣召到北京的旨意后，立即启程并于九月二十八日入宫觐见。
宫里的太监带着孙传庭由孙传庭不到三十岁岁一副老练成熟的样子，似乎透漏着一股军人的气息，不愧是能够镇压高迎祥，李自成等造反的狠人。
行过礼后，朱由校赐座与他。然后对孙传庭说道：“朕听闻孙卿永城任知县以来，办事雷厉风行，行事得体，想必是不可多得的人才。今日朕召见你，便是想知道孙卿对我大明官兵有何见解，其积弊在何。”
“陛下，臣官职卑微，不敢妄言军事。”
“孙卿尽管畅所欲言，如魏征当年向太宗劝谏一般向朕提供意见，朕虚心求教，无须顾忌太多。”
“谢皇上，微臣就斗胆妄言了。大明官军积弊有四：
一为军饷不足，如今朝廷打仗主要依靠营兵，营兵打仗是为了拿饷银，没有饷银容易影响士气，甚至可能造成哗变；
二为训练太少，微臣观察官兵缺乏足够训练，前几年萨尔浒之战中除戚家军和白杆兵训练有素，能够抵挡数倍于己的建奴军队，反观其他官军，往往需要；
三为火器不足且质量差，我大明官军对鞑虏所占有的优势就是火铳与火炮，若能够使官军装备大量合格的火器，必能够扭转劣势。
再就是军中老弱多而青壮少，打仗拼的是体力，老弱病残没有充足的体力，作战时体力跟不上，无法与体强力壮的敌军抗衡。
此四弊其实归结一起，终究还是在于朝廷的拨款。粮饷拨发多了，自有民壮愿从军者前来应征，士兵就会积极打仗，报效朝廷。有足够的钱便可修葺火器，增加军队火器比重，提高火器威力。
然而，朝廷拨发军饷给士兵，经手的次数愈多，到士兵手上的饷银就愈少，而用于装备火器的银子也就越少，层层克扣之下朝廷的拨款自然就不够了。