会议开完后，马铖带上自己的五千神机营，离开正阳门去自己的指挥部。
这个指挥部的挑选可耗费了马铖不少精力，这个地点要四通八达地处交通要道，还要距离和正阳门、聚宝门主战场不远不近。马铖在辇图上选了半天，终于挑选了应天府衙当这个指挥部。
应天府衙在后世南京府西街和中华路的交汇处，这里正好地处中城，和聚宝门、三山门、通济门、正阳门都有主干道联通，同时这里距离聚宝门五里路，距离正阳门六里路，完全可以保证出现问题时增援部队可以在半个时辰内赶到。
同时应天府对面就是承恩寺，这个由明宣宗时期的大太监王瑾建成的寺庙，占地数百亩，里面空地很多正好可以当成驻军之所。
马铖带着军队来到应天府门前，守门的衙役看到这么多军队来了，吓的赶紧进去禀报知府吴家周知晓。吴家周是天启五年三甲进士，党附东林才当上应天府知府，现在东林党倒台了正在六神无主，听马士英的儿子马铖来了，赶紧出来亲自迎接。
要知道应天是首都，应天府知府是从三品，和侍郎、布政使等高官同级，现在出来迎接马铖这么一个武将，吴家周真是丢了士大夫的脸。
“马大人，下官吴家周，恭迎马大人大驾光临！”吴家周满脸媚笑，深施一躬后看着马铖。
马铖骑在高头大马上撇着嘴点了点头：“吴知府，本督奉皇帝陛下的圣旨负责抵御北虏，你的应天府地理位置重要，所以本督决定在这建立本督的衙门，你可同意？”
吴家周听马铖这么说心中大骂：你不是自己有衙门吗？跑城里强占我的衙门干什么？
不过现在东林党已经树倒猢狲散，吴家周可不敢得罪马士英的儿子，没办法只好苦笑道：“马大人既然有旨意，下官自然全力配合！”
马铖听吴家周这么说笑道：“好，不过你这里地方不够大，烦劳知府大人派出衙役沟通承恩寺，让本督的士兵进驻！”
吴家周没办法只好叫来都头，让他带领马铖的士兵去对面的承恩寺。
马铖安排顾长卫带着四千人去承恩寺，许大虎带着一千人进驻应天府衙。吴家周看到这么多人要进驻，赶紧说道：“大人，这些士兵能不能都去承恩寺，本衙实在没有这么多空房间啊！”
马铖一瞪眼睛骂道：“怎么？没空房间就让你们的衙役书办滚蛋，本督的士兵有一个没地方安置就拿你是问！”
马铖说完不管吴家周，带着亲兵迈步进了应天府衙。马铖手下的士兵则各个如狼似虎，将应天府中的衙役、书办、师爷统统撵了出来。
应天府的同知看马铖闹的不像样子，站出来想要斥责马铖不懂规模，那知道马铖管你那些，让士兵连抽这家伙十个大嘴巴，打的后槽牙都掉了两个。
看到这帮丘八如此蛮横，府衙众人不敢
迟疑，只好带着自己的细软逃出府衙。
吴家周看这个样子叹了口气，反正现在兵荒马乱的，吴家周只好给那些衙役放假。
马铖看吴家周要给衙役放假，赶紧拦住说道：“正好城外徐沾处需要人手，你们这帮废物都去帮忙！”
徐沾是溧水县令，归应天府管理，现在让上官去给下级当帮手，大家一个个都十分不满。
但是不满你能怎么地？人家马铖有枪杆子，没办法吴家周只好将十几个有品级的官员留下，剩下的一百多个吏员都派出去归徐沾管理。
南京城里寸土寸金，应天府衙原本就不大，马铖的一千士兵在加上五百亲兵进来后马上拥挤不堪，就连大堂、二堂等重要地方都搭起了铺盖。
马铖带着几个将领往后走，来到三堂，这里已经是属于知府的私人空间，再往后就是内宅了。马铖看了看这个三堂环境不错，院子里种了几棵树木，环境很是僻静。